Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lgr5Q9Z1P4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lgr5Q9Z1P4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lgr5Q9Z1P4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms