Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms