Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cog1Q9Z160 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cog1Q9Z160 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms