Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cldn13Q9Z0S4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cldn13Q9Z0S4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cldn13Q9Z0S4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cldn13Q9Z0S4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn13Q9Z0S4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cldn13Q9Z0S4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cldn13Q9Z0S4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cldn13Q9Z0S4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cldn13Q9Z0S4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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