Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cib1Q9Z0F4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms