Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChrdQ9Z0E2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChrdQ9Z0E2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms