Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VapaQ9WV55 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms