Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP1

Ramp3, Receptor activity-modifying protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp3Q9WUP1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ramp3Q9WUP1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms