Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms