Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vax2Q9WTP9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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