Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam50bQ9WTJ8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms