Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma4Q9R1P0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms