Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec4eQ9R0Q8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec4eQ9R0Q8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms