Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed2Q9R0Q3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms