Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plod3Q9R0E1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms