Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh2d3cQ9QZS8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms