Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a3Q9QZS0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms