Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms