Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn4Q9QXZ9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn4Q9QXZ9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms