Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nufip1Q9QXX8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms