Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx8Q9QXV1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms