Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms