Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb1Q9QXJ1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms