Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Limd1Q9QXD8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms