Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Homer2Q9QWW1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer2Q9QWW1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms