Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk1eQ9JMK2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms