Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crlf1Q9JM58 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Crlf1Q9JM58 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms