Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Rabgef1Q9JM13 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Rabgef1Q9JM13 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Rabgef1Q9JM13 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Rabgef1Q9JM13 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rabgef1Q9JM13 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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