Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLZ8

Sigirr, Single Ig IL-1-related receptor, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SigirrQ9JLZ8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SigirrQ9JLZ8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SigirrQ9JLZ8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms