Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Tmod4Q9JLH8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Tmod4Q9JLH8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Tmod4Q9JLH8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Tmod4Q9JLH8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Tmod4Q9JLH8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Tmod4Q9JLH8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Tmod4Q9JLH8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmod4Q9JLH8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Tmod4Q9JLH8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Tmod4Q9JLH8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Tmod4Q9JLH8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod4Q9JLH8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
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