Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin3Q9JLB9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin3Q9JLB9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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