Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
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Gde1Q9JL56 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
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Gde1Q9JL56 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Gde1Q9JL56 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Gde1Q9JL56 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Gde1Q9JL56 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Gde1Q9JL56 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Gde1Q9JL56 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Gde1Q9JL56 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Gde1Q9JL56 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Gde1Q9JL56 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Gde1Q9JL56 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Gde1Q9JL56 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gde1Q9JL56 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms