Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx5Q9JKQ4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms