Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrac1Q9JKP8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms