Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp39a1Q9JKJ9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms