Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alyref2Q9JJW6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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