Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms