Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc9Q9JHI7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms