Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms