Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtofQ9ESF1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms