Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc28a3Q9ERH8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc28a3Q9ERH8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc28a3Q9ERH8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc28a3Q9ERH8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc28a3Q9ERH8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc28a3Q9ERH8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc28a3Q9ERH8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc28a3Q9ERH8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc28a3Q9ERH8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc28a3Q9ERH8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc28a3Q9ERH8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms