Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap29Q9ERB0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms