Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tfip11Q9ERA6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfip11Q9ERA6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms