Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Barx1Q9ER42 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Barx1Q9ER42 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Barx1Q9ER42 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Barx1Q9ER42 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Barx1Q9ER42 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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