Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf8Q9EQH4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf8Q9EQH4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms