Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vmn1r44Q9EQ47 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Vmn1r44Q9EQ47 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Vmn1r44Q9EQ47 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Vmn1r44Q9EQ47 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Vmn1r44Q9EQ47 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Vmn1r44Q9EQ47 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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