Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS4

Vmn1r172, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r172Q9EPS4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms