Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms