Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r53Q9EP93 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r53Q9EP93 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms