Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD03

Rab13, Ras-related protein Rab-13, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab13Q9DD03 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab13Q9DD03 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab13Q9DD03 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms